MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-3

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015908	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015908	AGG	2	6	3359	3364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015908	AGG	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015908	TAAAG	2	10	11899	11908	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015908	T	6	6	13729	13734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015908	T	6	6	15145	15150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015908	TA	3	6	15171	15176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015908	A	7	7	15193	15199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015908	TAA	2	6	16546	16551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015908	TATT	2	8	16574	16581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015908	T	6	6	16927	16932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015908	A	7	7	16948	16954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015908	CAAT	2	8	17045	17052	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015908	ATA	2	6	17065	17070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015908	CTA	2	6	17667	17672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015908	ATA	2	6	17683	17688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015908	ATA	2	6	17698	17703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015908	TAA	2	6	17727	17732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015908	TTA	2	6	17738	17743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015908	ATT	2	6	17747	17752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015908	A	7	7	17756	17762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015908	TAG	2	6	18211	18216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015908	TAA	2	6	19285	19290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015908	TA	3	6	19296	19301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015908	CTT	2	6	19322	19327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015908	A	6	6	19343	19348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015908	TAT	3	9	19403	19411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015908	ATA	2	6	19449	19454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015908	TTAAA	2	10	19492	19501	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015908	TAA	2	6	19554	19559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015908	T	6	6	19573	19578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015908	TAA	2	6	19616	19621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015908	TAT	2	6	19626	19631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015908	AGG	2	6	22078	22083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015908	TAA	2	6	23220	23225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015908	TA	3	6	23231	23236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015908	T	6	6	23261	23266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015908	TTTTA	2	10	23290	23299	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015908	ACAAAT	2	12	23300	23311	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015908	TTAT	2	8	23355	23362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015908	TAA	2	6	23371	23376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015908	TTA	2	6	23400	23405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015908	ATTA	2	8	23439	23446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015908	TAA	2	6	23447	23452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015908	TA	4	8	23486	23493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015908	A	6	6	23509	23514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015908	A	7	7	23528	23534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015908	TAAA	2	8	23578	23585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015908	T	7	7	23595	23601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015908	A	6	6	23616	23621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015908	TA	3	6	23643	23648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015908	ATT	2	6	23649	23654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015908	A	6	6	25013	25018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015908	AAAG	2	8	25021	25028	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015908	AAGTAA	2	12	26295	26306	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015908	AGA	2	6	26420	26425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015908	T	6	6	26431	26436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015908	AAGA	2	8	26449	26456	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015908	TAA	2	6	26471	26476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015908	AATTT	2	10	26493	26502	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015908	T	6	6	26520	26525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015908	GA	3	6	26548	26553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015908	A	6	6	26637	26642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015908	TATT	2	8	26646	26653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015908	GA	3	6	26683	26688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015908	TA	3	6	27752	27757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015908	CAA	2	6	28518	28523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015908	AAG	2	6	28543	28548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.